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《激光生物學報》 2020年04期
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黃芪多糖對C3H10T1/2細胞棕色脂肪分化中長鏈非編碼RNA表達譜的影響

張世和  曹宇鑫  鄧步皓  高旭陽  趙俊星  
【摘要】:本試驗旨在探究黃芪多糖(APS)對小鼠間充質干細胞C3H10T1/2細胞棕色脂肪化過程中長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達譜的影響。試驗以C3H10T1/2細胞為研究對象,在成脂誘導分化培養液中添加0.4 g/L的APS,以誘導分化1.5 d的細胞構建文庫后測序,篩選差異m RNAs和差異lncRNAs,并對差異m RNAs和差異lncRNAs的順式及共表達作用預測的靶基因進行了功能分析。通過熒光定量PCR隨機分析了3個lncRNAs和3個m RNAs的表達水平,驗證了測序結果的準確性。研究結果表明,本次測序共得到13 450個lncRNAs和57 776個m RNAs。通過對其表達量、長度、外顯子個數和成對重復性檢驗分析證明了測序數據的可靠性較好。篩選共得到153個差異表達的lncRNAs和1 238個差異表達的m RNAs。結果表明,差異m RNAs主要基因本體(GO)注釋富集在53個功能分類中,京都基因與基因組百科全書(KEGG)分析富集在343條通路中。差異lncRNAs順式及共表達作用預測的靶基因GO注釋分別富集在34和33個功能分類中,在分子功能中條目一致。KEGG分析顯示,多個基因富集在脂肪代謝和脂肪分化的信號通路中,尤其在胰高血糖素及cAMP信號通路中富集顯著。綜上表明,APS導致了C3H10T1/2細胞成脂分化中lncRNA表達譜的變化。本研究結果可為進一步解析APS對干細胞的分化調節提供科學依據。

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