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《激光生物學報》 2020年04期
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雨生紅球藻己糖激酶基因的克隆和生物信息學分析

石穎  宋亞楠  張宏江  季春麗  張春輝  李潤植  崔紅利  
【摘要】:本研究以雨生紅球藻(Haematococcus pluvialis)為研究對象,利用同源克隆和cDNA末端快速擴增技術(RACE)相結合的方法獲得了雨生紅球藻己糖激酶(HaeHK)基因的cDNA全長序列,并進行了序列分析。結果表明,HaeHK的cDNA全長為2 047 bp,其中開放閱讀框的長度為1 716 bp,編碼571個氨基酸。該蛋白預測的等電點(pI)為6.49,理論分子量為60.61 kD。經在線BLAST同源比對分析發現,其與團藻(Volvox carteri)和萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)來源HKs的相似性分別達到50%和46%。通過序列比對和結構域分析可知,HaeHK蛋白存在與高等植物來源HKs相似的結構域,且具有HK家族的顯著特征。高級結構同源建模表明其具有典型的“蝴蝶”結構。系統進化分析顯示,高等植物和真核綠藻(Chlorophyta)來源HKs可能來自共同的祖先。本文首次從雨生紅球藻中獲得編碼HaeHK的基因序列,為雨生紅球藻中HK的表達和功能研究奠定基礎,同時為解析雨生紅球藻己糖利用及代謝的分子機制提供線索。

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